Nguồn vốn để thực hiện dự án đầu tư xây dựng trụ sở mới gồm: Tiền đấu giá quyền sử dụng khu đất và trụ sở làm việc cũ tại 37 Lê Đại Hành - Hai Bà Trưng nằm trên khuôn viên khu đất có diện tích 1,3 ha, một phần từ ngân sách.
Do vị trí đất nằm ở khu vực có nhiều trung tâm thương mại, BQLDA Bộ Xây dựng khi đó từng lên kế hoạch mời thầu, tổ chức bán đấu giá xây biệt thự giúp mang lại giá trị kinh tế cao hơn. Tuy nhiên, cho đến nay việc di dời trụ sở Bộ Xây dựng vẫn chưa được triển khai.