Theo tính toán của các nhà chuyên môn, diện tích toàn hồ gấp 100 lần diện tích lúc thử nghiệm nên nếu làm với mô hình cũ có thể phải kéo dài tới 1.000 ngày mới thực hiện xong.
Để rút ngắn, có thể tổ chức làm ba ca một ngày. Ngoài ra nên tăng công suất máy hút bùn, ép bùn. Khi thử nghiệm, chỉ 1/10 diện tích hồ (khoảng 1000m2) được hút bùn. Hệ thống bơm chỉ làm việc dạng thăm dò, 2 tiếng rưỡi một ngày, chứ chưa làm hết công suất thiết kế.
Để thực hiện hút bùn, các nhà khoa học sẽ chia mặt nước hồ theo theo ô và làm dần dần từng ô để tránh gây xáo động lớn tới cụ Rùa và các vi sinh vật sống trong hồ.
Toàn bộ các thiết bị của Đức lắp đặt chạy thử nghiệm ở Hồ Gươm sẽ được Việt Nam mua lại với tổng giá trị ước tính khoảng 300.000 USD. Phía Đức sẽ tiếp tục cử chuyên gia giúp cán bộ Việt Nam khâu kỹ thuật.
Trước đó, trong đợt thử nghiệm, khoảng 600 khối bùn nước đã được hút lên.