Trong số các bị can có ông Nguyễn Thế Dũng, nguyên Tổng giám đốc Cty TNHH MTV Dầu khí Đồng Tháp (Cty Petimex – doanh nghiệp nhà nước trực thuộc UBND tỉnh Đồng Tháp); Phạm Văn Khương, nguyên Đội trưởng thuộc Chi cục Hải quan Cẩm Phả; Trần Mạnh Hùng, nguyên cán bộ Chi cục Hải quan cửa khẩu Cái Lân và Đinh Văn Long, nguyên cán bộ Chi cục Hải quan Vạn Gia (Quảng Ninh). Riêng hai bị can Long và Hùng bị truy tố về tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”, các bị can còn lại đều bị truy tố về tội “Buôn lậu”.
Cáo trạng nêu rõ, từ cuối năm 2011 - tháng 7/2012, Nguyễn Thế Dũng đã chỉ đạo nhân viên dưới quyền kết hợp với Cty Vận tải biển Đông Á do Trương Hữu Có làm giám đốc; Cty Cổ phần Thủy sản Minh Khuê do Đặng Thu Ngân làm giám đốc (bị can Ngân là vợ cựu Đội trưởng Hải quan Phạm Văn Khương, hiện Ngân đang bỏ trốn) và một số đối tượng khác lợi dụng chính sách tạm nhập, tái xuất hàng hóa để buôn lậu dầu diesel.
Theo bàn bạc, Nguyễn Thế Dũng sẽ tạm nhập dầu diesel về Hải Phòng và Quảng Ninh bán lại cho Trương Hữu Có và Đặng Thu Ngân. Sau đó, hai đối tượng này tiếp tục vận chuyển bằng đường bộ qua cửa khẩu Tà Lùng, tỉnh Cao Bằng và Mường Khương, tỉnh Lào Cai; trên tuyến đường thủy, các đối tượng vận chuyển qua cảng Vạn Gia (Quảng Ninh) để bán cho các đối tượng buôn lậu người Trung Quốc.
Để qua mắt cơ quan chức năng, Nguyễn Thế Dũng đã chỉ đạo bị can Nguyễn Ngọc Thi, nguyên Phó trưởng phòng xuất nhập khẩu Cty Petimex lấy pháp nhân của một doanh nghiệp Trung Quốc, soạn thảo hợp đồng nguyên tắc mua bán xăng dầu, nhằm làm giả hồ sơ tái xuất xăng dầu… Bằng thủ đoạn trên, Dũng đã chỉ đạo tạm nhập gần 7,7 nghìn tấn dầu diesel về Chi cục Hải quan cảng Hải Phòng khu vực 1 và Chi cục Hải quan Vạn Gia để bán cho Trương Hữu Có hơn 1 nghìn tấn dầu, Ngân hơn 3 nghìn tấn dầu và bị can Vi Văn Dũng, trú tại thành phố Móng Cái, Quảng Ninh gần 3,5 nghìn tấn dầu. Số còn lại tiêu thụ trong nội địa. Theo kết quả điều tra, trị giá số dầu diesel mà các đối tượng đã buôn lậu là hơn 168 tỷ đồng, gây thiệt hại gần 22,5 tỷ đồng tiền thuế.
Đối với 3 cán bộ hải quan, cơ quan tố tụng xác định, Phạm Văn Khương đã cùng vợ là Đặng Thu Ngân bàn bạc về việc mua bán dầu tạm nhập tái xuất với Nguyễn Thế Dũng tại cảng Vạn Gia (Quảng Ninh). Còn Long và Hùng được phân công thực hiện giám sát song lại qua loa, đại khái, tiến hành kẹp chì hải quan, lập, ký biên bản niêm phong, giả chữ ký ở phần đại diện doanh nghiệp cho đủ thủ tục, tạo kẽ hở để các đối tượng buôn lậu.