Cáo trạng của Viện KSND tỉnh thể hiện, từ tháng 6/2020 đến tháng 1/2021 trên địa bàn TP Hồ Chí Minh và tỉnh Phú Yên, Ngô Công Trứ thông qua mạng xã hội, biết rõ tổ chức “Chính phủ quốc gia Việt Nam lâm thời” (CPQGVNLT) là tổ chức phản động lưu vong do Đào Minh Quân đang sống tại Mỹ cầm đầu, nhưng Trứ đã đồng tình, ủng hộ cương lĩnh, điều lệ.
Đồng thời, Trứ làm đơn tự nguyện tham gia tổ chức và được kết nạp là thành viên nhằm cùng tổ chức này xóa bỏ vai trò lãnh đạo của Đảng, lật đổ Nhà nước dưới nhiều hình thức khác nhau.
Ngoài ra, Trứ còn kích động, nói xấu lãnh tụ và vận động nhiều người tham gia tổ chức CPQGVNLT nhằm lật đổ chế độ và Nhà nước ta.