Vốn điều lệ của quỹ do ngân sách nhà nước cấp 2.000 tỷ đồng, trong 2 năm đầu, mỗi năm được cấp 500 tỷ đồng, năm thứ ba cấp 1.000 tỷ đồng. Quỹ hoạt động phi lợi nhuận, bảo toàn và phát triển vốn; được miễn các loại thuế và các khoản nộp ngân sách nhà nước.
Quỹ được ủy thác cho các ngân hàng thương mại cho vay theo nguyên tắc ngân hàng tự quyết định và chịu rủi ro tín dụng với các khoản vay đó.