Theo thống kê ban đầu, toàn huyện đã bị thiệt hại khoảng 300 tấn nghêu thương phẩm. Trước tình hình trên, Chi cục Chăn nuôi và Thú y (Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn tỉnh Trà Vinh) đã lấy mẫu bệnh phẩm nghêu gởi Chi cục Thú y Vùng VII phân tích. Kết quả, mẫu nghêu bị nhiễm ký sinh trùng Perkinsus spp (ký sinh trùng gây dịch bệnh và chết nhiều trên nhuyễn thể) với tỉ lệ và cường độ nhiễm cao (tỉ lệ 90%, cường độ cảm nhiễm là 49,1 bào tử/gram thịt). Đồng thời, phát hiện vi khuẩn Vibrio parahaemolyticus (vi khuẩn gây bệnh gan tuỵ trên động vật thuỷ sản) trong mẫu nghêu thịt và nhóm Vibrio spp (nhóm vi khuẩn có hại gây nhiều bệnh nguy hiểm trên động vật thuỷ sản) trong mẫu nước vùng nuôi nghêu.
Hiện huyện Châu Thành có tổng diện tích nuôi nghêu 300 ha do Tổ hợp tác nuôi nghêu ấp Hai Thủ và Hợp tác xã nuôi nghêu Tiến Thành sản xuất trên địa bàn xã Long Hoà, với 434 thành viên, tổng vốn góp hơn 6,6 tỷ đồng. Những vụ sản xuất trước đây, sau 18 tháng thả giống, sản lượng nghêu thương phẩm thu hoạch đạt khoảng 800 tấn/vụ, lợi nhuận bình quân được chia cho các thành viên từ 60-100% vốn góp. Tuy nhiên vụ nghêu này, với giá nghêu thương phẩm 24.000 đồng/kg hiện nay, 2 bãi nghêu của huyện Châu Thành thất thu hơn 7 tỉ đồng; tình trạng thiệt hại chỉ xuất hiện ở nghêu đạt kích cỡ thương phẩm, tức khoảng 50-60 con/kg, còn nghêu nhỏ không bị ảnh hưởng.
Hiện ngành nông nghiệp chỉ đạo cơ quan chuyên môn phối hợp với địa phương đã vận động người nuôi chủ động thu hoạch nghêu đạt trọng lượng thương phẩm và ngưng thả giống mới. Đồng thời theo dõi chặt chẽ diễn biến môi trường vùng nuôi và dịch bệnh trên nghêu nuôi.
Hiện ngành nông nghiệp tỉnh Trà Vinh đã khuyến cáo các tổ hợp tác, hợp tác xã thu hoạch nghêu và ngưng thả giống mới để hạn chế dịch bệnh lây lan ra diện rộng.