Theo đó, Thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo UBND thành phố Hà Nội thực hiện một số nhiệm vụ sau: Với dự án cải tạo môi trường Hồ Đầu Băng: Giai đoạn 2 yêu cầu khẩn trương hoàn thành công tác chuẩn bị đầu tư, bao gồm việc phê duyệt điều chỉnh kinh phí giải phóng mặt bằng để tổ chức thực hiện dự án đảm bảo tiến độ theo quy định. Đối với quỹ đất 5%, kiến nghị UBND thành phố Hà Nội thực hiện và quản lý việc cho thuê quỹ đất 5% theo đúng các quy định của pháp luật đất đai về quy hoạch, kế hoạch sử dụng đất.
Với dự án cải tạo và xây dựng Hệ thống cống nối hồ Vục-hồ Đầu Băng-hồ Tư đình theo hình thức hợp đồng BT: Thanh tra chính phủ kiến nghị UBND thành phố Hà Nội rà soát, đảm bảo thực hiện các thủ tục liên quan đến chỉ định nhà đầu tư dự án đảm bảo quy định hiện hành tại thời điểm thực hiện dự án. Khẩn trương phê duyệt điều chỉnh dự án để tiếp tục triển khai thi công theo tiến độ. Qua điều chỉnh rà soát xác định lại nghĩa vụ tài chính để điều chỉnh hợp đồng BT và thực hiện thanh, quyết toán đúng quy định.
Với dự án xây dựng công trình hạ tầng kỹ thuật và nhà ở 14,5ha tại khu chức năng đô thị Tây Nam đường 70, phường Đại Mỗ, quận nam Từ Liêm: Yêu cầu nhà đầu tư nộp bổ sung vào ngân sách nhà nước 44,364 tỷ đồng tiền giải phóng mặt bằng chưa tách khỏi dự án BT. Hoàn thiện thủ tục về đất đai và đầu tư xây dựng đối với 2 con đường có diện tích 0,67ha, kết nối giao thông trong khu quy hoạch 30,5ha được duyệt theo quy định. Căn cứ quyết định phê duyệt điều chỉnh dự án BT xác định nghĩa vụ tài chính nhà đầu tư phải nộp theo quy định.
Dự án tại ô đất DX1, DX2, DX3, DX4, CX2 và CX1 khu đô thị Đông Nam Trần Duy Hưng: Thanh tra Chính phủ kiến nghị thực hiện tiếp tục theo các nội dung tại kết luận số 1168 năm 2014 của Thanh tra thành phố Hà Nội. Chỉ đạo Sở tài chính, Cục thuế Hà Nội kiểm tra, rà soát tiền thuê đất và thu hồi bổ sung số tiền sử dụng đất để tránh thất thoát ngân sách nhà nước, do không thực hiện tính lại giá đất phần diện tích tăng thêm xây dựng sai quy hoạch, phần giá nộp suất đầu tư hạ tầng theo đúng quy định. Thành phố Hà Nội phải rà soát lại quy hoạch khu đất cho thuê thuộc đô thị mới Đông nam Trần Duy Hưng theo đúng mục tiêu ban đầu; kiểm điểm và xử lý cán bộ liên quan trong thực hiện kết luận của Thanh tra thành phố Hà Nội.
Dự án cải tạo nâng cấp Quốc lộ 6: Thanh tra Chính phủ kiến nghị rà soát lại toàn bộ quỹ đất được đề xuất dùng làm quỹ đất đối ứng dự án BT để đưa vào đấu giá quyền sử dụng đất để tạo vốn để thực hiện dự án đầu tư công bằng nguốn vốn ngân sách nhà nước. Trường hợp UBND thành phố Hà Nội vẫn tiếp tục thực hiện dự án theo hình thức hợp đồng BT thì phải thực hiện đúng quy định pháp luật về đầu tư BT, tránh gây thất thoát ngân sách nhà nước.
Dự án khu đô thị mới Hoàng Văn Thụ, quận Hoàng Mai: Kiến nghị thành phố Hà Nội chỉ đạo UBND quận Hoàng Mai kiểm tra các hộ lấn chiếm để giải phóng mặt bằng dự án; xử lý theo quy định của pháp luật những hộ, cá nhân lấn chiếm, mua bán trái pháp luật.
Cũng theo Thanh tra Chính phủ, riêng với các sai phạm trong công tác chuẩn bị đầu tư dự án cải tạo nâng cấp Quốc lộ 6, phải kiểm điểm làm rõ trách nhiệm các cán bộ của Sở KH&ĐT về các tờ trình liên quan dự án nâng cấp quốc lộ 6 để có hình thức xử lý nghiêm theo quy định…