Theo Ban tổ chức, năm 2008, hơn 3.000 học sinh tham gia thì đến năm 2009, cuộc thi thu hút hơn 5.000 học sinh lớp 6, 7, 8, 10, 11 hệ chuyên và không chuyên đang học tại các trường THCS và THPT trên toàn quốc.
Năm 2010, cuộc thi Olympic Hà Nội - Amsterdam bắt đầu bằng vòng loại trực tuyến trên Hocmai.vn ngày 8 - 3, đến hết ngày 14 - 3 với các môn thi: toán, ngữ văn, tiếng anh (lớp 6, 7, 8, 10, 11), vật lí, hóa học (lớp 8, 10, 11).
Học sinh làm bài theo hình thức trắc nghiệm khách quan, mỗi đề thi gồm 25 câu trong thời gian tối đa 45 phút.
Để làm bài thi trực tuyến, học sinh truy cập vào website www.hocmai.vn, đăng kí và nạp tiền vào một tài khoản duy nhất. Lệ phí thi là 25.000 đồng.
Danh sách 80 - 120 học sinh có số điểm cao nhất của mỗi môn sẽ được thông báo trên các phương tiện thông tin chính thức của Ban tổ chức sau ngày 14 - 3 và thông báo về trường trước ngày 17 - 3.
Những học sinh vượt qua vòng loại sẽ thi Chung kết tại trường THPT Chuyên Hà Nội - Amsterdam vào ngày 27 - 3 (chi phí đi lại, ăn ở cho kỳ thi do học sinh tự túc).
Học sinh thi tự luận tất cả các môn, trừ tiếng anh thi trắc nghiệm. Lệ phí thi: 60.000 đồng/một môn thi/học sinh. Thí sinh có thể đăng ký và nộp tiền theo trường đang học hoặc qua tài khoản đã đăng kí trên trang web Hocmai.vn hoặc nộp trực tiếp tại Phòng tài vụ trường THPT Chuyên Hà Nội - Amsterdam trước ngày 22 - 3.
Bài thi được chấm tập trung, xét giải theo điểm từ cao xuống thấp với từng môn thi của mỗi khối lớp.
Thí sinh vượt qua vòng loại sẽ được cộng 50.000 đồng vào tài khoản trên trang web Hocmai.vn.để sử dụng cho việc học tập trên mạng tại trang web này.
Nếu đạt giải nhất, thí sinh được thưởng 500.000 đồng và thẻ trị giá 270.000 đồng (học trên trang hocmai.vn).
Giải nhì gồm phần thưởng 200.000 đồng và thẻ trị giá 270.000 đồng.
Giải ba: 100.000 đồng và thẻ trị giá 100.000 đồng.
Giải khuyến khích: 50.000 đồng và một thẻ trị giá 50.000 đồng.