Theo Tổng cục Hải quan, thực hiện chủ trương, định hướng của Trung ương về sắp xếp tổ chức bộ máy, tổng cục đã khẩn trương xây dựng, hoàn thiện Đề án sắp xếp tổ chức bộ máy của đơn vị để báo cáo Bộ Tài chính xem xét.
Theo phương án sắp xếp, hệ thống tổ chức của ngành hải quan đề xuất sẽ gồm 3 cấp là: Hải quan Việt Nam; hải quan khu vực/vùng; hải quan cửa khẩu/ngoài cửa khẩu, đồng thời sắp xếp, tổ chức lại các đơn vị bên trong của Hải quan Việt Nam bảo đảm tinh gọn, giảm đầu mối cấp trung gian, hoạt động hiệu lực, hiệu quả.
Hải quan Việt Nam sẽ là đơn vị tương đương cấp cục trực thuộc Bộ, thực hiện chức năng tham mưu, giúp Bộ trưởng Bộ Tài chính quản lý nhà nước về hải quan và tổ chức thực thi pháp luật về hải quan trong phạm vi cả nước.
Trên cơ sở chức năng, nhiệm vụ được giao, Hải quan Việt Nam sẽ tổ chức, sắp xếp lại từ 16 đầu mối giảm xuống dự kiến còn 12 đầu mối tham mưu (giảm 4 đầu mối, tương đương 25%). Trong đó, một số đơn vị được thành lập các phòng/đội để thực hiện tham mưu và trực tiếp thực hiện công tác thuộc phạm vi chức năng nhiệm vụ, quyền hạn được giao. Số lượng dự kiến khoảng 55 phòng/đội (giảm 21 đầu mối, tương đương 27,6%).
Với các cục hải quan địa phương, Tổng cục Hải quan dự kiến phương án sắp xếp lại 35 cục hiện nay thành 15 hải quan khu vực/vùng.
Tiếp dưới là hải quan khu vực/vùng. Đây là các tổ chức trực thuộc Hải quan Việt Nam (là đơn vị tương đương chi cục trực thuộc cục). Căn cứ vào địa bàn quản lý, yêu cầu thực tiễn trong công tác quản lý, Tổng cục Hải quan dự kiến phương án sắp xếp lại 35 cục hải quan hiện nay thành 15 hải quan khu vực/vùng (giảm 20 đầu mối, tương đương 57,14%) để quản lý hoạt động hải quan trên địa bàn 63 tỉnh, thành phố.
Cấp thứ 3, hải quan cửa khẩu/ngoài cửa khẩu là đơn vị trực thuộc hải quan vùng trực tiếp thực hiện nhiệm vụ kiểm tra, giám sát và kiểm soát hải quan trên địa bàn cửa khẩu, các khu công nghiệp, khu chế xuất… được phân công. Hải quan cửa khẩu/ngoài cửa khẩu không có tổ chức cấu thành phần bên trong.
Thực hiện sự sắp xếp, tinh gọn bộ máy, Tổng cục trưởng Hải quan Nguyễn Văn Thọ đề nghị lãnh đạo các đơn vị thuộc và trực thuộc Tổng cục Hải quan, các công chức, viên chức, người lao động trong ngành Hải quan chung sức, đồng lòng, vượt qua khó khăn.
Tổng cục trưởng Nguyễn Văn Thọ đề nghị các đơn vị tập trung đánh giá tác động, kiến nghị các giải pháp để bộ máy mới đi vào hoạt động theo đúng chỉ đạo của Đảng, Chính phủ và Bộ Tài chính.