Ông Duân bị khởi tố về tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”, theo Điều 285 BLHS.
Sai phạm lớn nhất của ông Trần Minh Duân trong dự án Rusalka của Nguyễn Đức Chi là việc ông này đã “vội vã” ký cấp sổ đỏ cho 45 héc-ta đất dự án vào ngày 27/5/2003, trong khi dự án này còn thiếu các điều kiện để xin cấp sổ đỏ, như: chưa có hợp đồng thuê đất, chưa đóng tiền đền bù con đường đi qua dự án...
Theo cơ quan điều tra, việc ông Trần Minh Duân cấp sổ đỏ cho dự án Rusalka còn gây ra hậu quả gián tiếp. Có tấm sổ đỏ trong tay, Nguyễn Đức Chi đã khiến các nhà thầu tin tưởng, ứng tiền ra đầu tư xây dựng dự án Rusalka.
Tính đến khi bị bắt, Chi còn nợ các nhà thầu số tiền khoảng 70 tỷ đồng, không còn khả năng chi trả. Liên quan đến việc cấp sổ đỏ này, trước đó Viện KSND Tối cao đã phê chuẩn các quyết định khởi tố bị can đối với Mai Đức Chính và Vũ Xuân Thiềng (nguyên Giám đốc và Phó giám đốc Sở Tài nguyên – Môi trường tỉnh Khánh Hoà), về tội cố ý làm trái các quy định của nhà nước về quản lý kinh tế, gây hậu quả nghiêm trọng.
Đối với ông Trần Minh Duân, tại cơ quan điều tra ông Duân cho rằng do tin tưởng cấp dưới và sơ suất nên đã không kiểm tra kỹ hồ sơ khi cấp sổ đỏ cho Nguyễn Đức Chi.
Sau khi đề nghị cơ quan điều tra làm rõ ý thức chủ quan của ông Duân trong việc làm tắc trách trên, Viện KSND Tối cao đã quyết định phê chuẩn khởi tố bị can Trần Minh Duân về tội thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng, thay vì tội cố ý làm trái...
Vụ án vẫn đang được tiếp tục điều tra để làm rõ mức độ liên quan của một số cán bộ tỉnh Khánh Hoà cũng như của Bộ KH&ĐT, để xử lý theo pháp luật.