Theo cáo trạng, Sở Y tế tỉnh Long An đã được UBND tỉnh Long An giao làm chủ đầu tư xây dựng dự án Trung tâm kiểm nghiệm Dược phẩm - Mỹ phẩm, Trung tâm Giám định Y khoa, Trung tâm Pháp y và Chi cục An toàn vệ sinh thực phẩm.
Trong gói thầu cung cấp và lắp đặt hệ thống camera giám sát an ninh, ông Liêm là Giám đốc Sở Y tế tỉnh Long An và biết các thiết bị được nhà thầu là Cty Đông Nam Á nhập về đã bị thay đổi về xuất xứ hàng hóa và model so với hợp đồng nhưng không chỉ đạo thực hiện tham khảo lại giá, không phê duyệt điều chỉnh lại dự toán gây thất thoát 871 triệu đồng; thanh toán thừa khối lượng dây cáp mạng và ổ cứng lưu trữ so với thực tế thi công 40 triệu đồng.
UBND tỉnh Long An đã kết luận thanh tra xác định gói thầu còn đang thực hiện, chưa được phê duyệt quyết toán và giao Sở Y tế lập hồ sơ báo cáo thẩm tra để trình UBND tỉnh phê duyệt.
Tại phiên tòa và suốt quá trình tố tụng, ông Liêm cùng luật sư của ông cho rằng ông Liêm chưa gây hậu quả theo hành vi “Cố ý làm trái quy định của nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng”, vì khi ông Liêm bị khởi tố thì gói thầu này mới được phê duyệt quyết toán.