Theo Tổng cục Thủy lợi, từ khi có Nghị định 115 (năm 2008) của Chính phủ quy định về miễn thủy lợi phí cho nông dân, giúp người dân giảm 3-10% tổng chi phí sản xuất nông nghiệp; diện tích tưới, tiêu, năng suất được nâng lên; nhiều công trình thủy lợi (CTTL) có nguồn thu ổn định để duy tu, sửa chữa... phục vụ sản xuất.
Tuy nhiên, công tác quản lý thủy nông, chính sách thủy lợi phí ở nhiều địa phương còn nhiều bất cập. Nhiều CTTL bị xuống cấp, hiệu quả sử dụng thấp, nguồn nước cấp bị ô nhiễm (như sông Nhuệ, sông Đáy); lãng phí nước, điện năng; mức hỗ trợ thủy lợi phí nhiều nơi còn bất cập...
Thứ trưởng Bộ NN&PTNT Đào Xuân Học cho biết, để nâng cao hiệu quả sử dụng các CTTL, cần nghiên cứu, sửa đổi Nghị định 115 nhằm khắc phục những hạn chế hiện nay; đấu thầu quản lý các CTTL, việc hỗ trợ thủy lợi phí tính theo mét khối, quy định trình độ cán bộ quản lý các công trình, trạm bơm...