ói thầu số 4 của công trình này do Công ty Cơ khí Xây dựng và Lắp máy điện nước Hà Nội trúng thầu với tổng giá trị 20,714 tỷ đồng, được triển khai thi công từ năm 2002.
Theo điều tra ban đầu, ông Sơn đã tổ chức, chỉ đạo thi công gói thầu số 4 không đúng với hồ sơ thiết kế được duyệt, làm giảm khối lượng vật tư, không bảo đảm chất lượng, nhưng vẫn được thanh toán đủ theo hồ sơ dự toán kinh phí nhằm chiếm đoạt tài sản Nhà nước.