Theo kết luận này, việc quản lý sử dụng đất và đầu tư xây dựng công trình trên đất đối với Bến xe khách huyện Tân Yên thuộc Công ty Cổ phần xe khách Bắc Giang quản lý, khai thác có thiếu sót, sai phạm trong đầu tư và xây dựng. Cụ thể, về đầu tư, trong quá trình thực hiện dự án, Công ty Cổ phần xe khách Bắc Giang không chấp hành chế độ báo cáo tình hình thực hiện dự án, báo cáo giám sát, đánh giá đầu tư theo quy định.
Về xây dựng, trong quá trình thực hiện dự án, Công ty Cổ phần xe khách Bắc Giang chưa tuân thủ đúng trình tự, thủ tục về xây dựng công trình theo quy định, đã tổ chức thi công xây dựng một số hạng mục công trình sai nội dung giấy phép xây dựng được cấp, một số hạng mục công trình không có giấy phép như công trình bán mái (phía sau nhà bán hàng).
Kết luận thanh tra chỉ ra, trách nhiệm để xảy ra các thiếu sót, sai phạm nêu trên thuộc về Công ty Cổ phần xe khách Bắc Giang, Sở Kế hoạch và Đầu tư tỉnh Bắc Giang, Sở Xây dựng tỉnh Bắc Giang và UBND huyện Tân Yên.
Thanh tra tỉnh Bắc Giang đề nghị Giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư tỉnh Bắc Giang theo thẩm quyền chỉ đạo cơ quan chức năng kiểm tra, xem xét, hoàn thiện các thủ tục tiến hành xử phạt vi phạm hành chính đối với Công ty Cổ phần xe khách Bắc Giang về hành vi không thực hiện chế độ báo cáo hoạt động đầu tư, báo cáo giám sát, đánh giá đầu tư định kỳ theo quy định. Chủ tịch UBND huyện Tân Yên chỉ đạo cơ quan chuyên môn thiết lập hồ sơ buộc Công ty khắc phục hậu quả vi phạm. Giám đốc Công ty Cổ phần xe khách Bắc Giang nghiêm túc rút kinh nghiệm trong việc để xảy ra các tồn tại, vi phạm nêu trên; tháo dỡ các công trình vi phạm sai phép, không phép.