Theo đó, VEC kiến nghị tăng từ 1.500 đồng/ xe tiêu chuẩn, xe con/km lên 2.000 đồng/CPU/km; tăng 500 đồng/CPU/km so với hiện nay. Mức tăng này có thể sẽ đẩy mức phí toàn chặng từ 70.000 đồng/xe lên 90.000 đồng/xe. Chặng Cầu Giẽ - Vực Vòng đối với xe con từ 20.000 đồng/xe lên 25.000 đồng/xe. Chặng Cầu Giẽ - Liêm Tuyền với xe du lịch từ 30.000 đồng/xe lên 40.000 đồng/xe.
VEC lí giải việc xin tăng phí là do tuyến đường cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình đưa vào khai thác toàn tuyến (dài 50km) từ 30.6 .2012 đến nay mà vẫn giữ mức phí như phương án ban đầu 1.500 đồng/CPU/km.
Đầu năm 2016, VEC đã hoàn thành thảm lớp tạo nhám trên toàn tuyến với giá trị đầu tư khoảng 589,95 tỷ đồng, hoàn thiện các hạng mục và làm tăng tốc độ lưu hành trên tuyến cao tốc đã được tăng từ 100km/h lên 120km/h. Tuyến cao tốc Cầu Giẽ - Ninh Bình đưa vào khai thác đã rút ngắn khoảng 1/2 thời gian lưu thông và tiết kiệm 15% chi phí vận tải so với lưu thông theo tuyến quốc lộ cũ.