Cụ thể, tỷ lệ giữa bác sỹ, điều dưỡng, kỹ thuật viên, hộ sinh chưa đảm bảo cơ cấu; tỷ lệ nhân viên y tế/giường bệnh kế hoạch cũng chưa đảm bảo theo quy định và đề án vị trí việc làm của các đơn vị đã xây dựng. Thanh tra tỉnh Bắc Giang cũng nêu, còn có đơn vị sử dụng bác sỹ chưa có chứng chỉ hành nghề dẫn đến cơ quan bảo hiểm xã hội (BHXH) đã từ chối thanh toán chi phí khám chữa bệnh.
Quá trình thanh tra cho thấy, việc quản lý hồ sơ đối với người hành nghề chưa đảm bảo khoa học, gây khó khăn trong quá trình truy xuất thông tin, thiếu thành phần hồ sơ theo quy định, chưa bổ sung đầy đủ các chứng chỉ đào tạo, chưa có bảng kê chi tiết. Thanh tra phát hiện còn tình trạng thực hiện thanh toán chi phí khám chữa bệnh không đúng với các quy định hiện hành, dẫn đến trong quá trình thẩm định, quyết toán cơ quan BHXH đã không chấp nhận thanh toán.
Theo kết luận của Thanh tra tỉnh Bắc Giang, cơ quan bảo hiểm xã hội tỉnh này đã không chấp nhận thanh toán chi phí khám chữa bệnh BHYT tại 6 bệnh viện bị thanh tra với tổng số tiền hơn 69 tỷ đồng. Trong đó, Bệnh viện Đa khoa tỉnh hơn 30 tỷ đồng; Bệnh viện Sản Nhi hơn 21 tỷ đồng; Bệnh viện Ung Bướu hơn 1,5 tỷ đồng; Bệnh viện Phục hồi chức năng hơn 3,3 tỷ đồng; Bệnh viện Đa khoa Sông Thương hơn 10,2 tỷ đồng và Bệnh viện Đa khoa Quốc tế Hà Nội - Bắc Giang hơn 2,4 tỷ đồng.
Các nội dung chính mà cơ quan BHXH không chấp nhận thanh toán là do: Thuốc, dịch truyền, dịch vụ kỹ thuật đã có trong cơ cấu giá dịch vụ kỹ thuật; thuốc ngoài danh mục sử dụng tại bệnh viện; thuốc chỉ định không đúng điều kiện tỷ lệ thanh toán; giá thuốc Y học cổ truyền cao hơn giá trúng thầu; sửa chữa số lượng thuốc không đúng quy định; chi phí vật tư y tế thực tế sử dụng thấp hơn so với định mức trong cơ cấu giá của dịch vụ kỹ thuật.