Cty Cổ phần Khoáng sản và Xi măng Cần Thơ được UBND TP Cần Thơ cấp giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư ngày 7-12-2005. Theo đó, thuế thu nhập doanh nghiệp 20%, những năm đầu được ưu đãi giảm 50%. Cty khai và nộp thuế đầy đủ.
Tháng 12-2008, Thanh tra Bộ Tài chính và cán bộ Cục Thuế TP Cần Thơ làm việc, xác định thuế thu nhập doanh nghiệp Cty phải nộp 28% chứ không phải 20%. Cty chấp nhận. Sau khi giảm ưu đãi 50%, Thanh tra Bộ Tài chính xác định số thuế truy thu năm 2006 và 2007; còn kiểm toán xác định tiếp số thuế truy thu năm 2008.
Theo đó, Cục Thuế TP Cần Thơ có công văn yêu cầu Cty nộp thuế truy thu. Cty nộp đủ, hoàn thành thuế thu nhập doanh nghiệp 3 năm.
Giữa năm 2009, Thanh tra Cục Thuế TP Cần Thơ làm việc, buộc Cty phải nộp thêm thuế thu nhập doanh nghiệp của 3 năm 2006, 2007, 2008 hơn 2 tỷ đồng nữa. Đây là khoản chênh lệch giữa hai quan điểm tính thuế ưu đãi.
Thanh tra Bộ Tài chính giảm 50% cho cả thuế suất 28%; Thanh tra Cục Thuế TP Cần Thơ chỉ giảm 50% cho thuế suất 20%, còn 8% không được giảm. Thanh tra Cục còn đề nghị phạt Cty hơn 173 triệu đồng.
Cuối năm 2009, Cục Thuế TP Cần Thơ ra quyết định buộc Cty nộp thêm hơn 2 tỷ đồng thuế và hơn 173 triệu đồng tiền phạt. Cty kiến nghị, xin được xử lý theo quan điểm của Thanh tra Bộ Tài chính và kiểm toán. Tranh cãi gần 2 năm, ngày 19-5-2011, Cục Thuế TP Cần Thơ ra quyết định bác khiếu nại của Cty.
PV Tiền Phong đến Cục Thuế TP Cần Thơ. Ông Nguyễn Minh Còn, Phó trưởng phòng Kiểm tra thuế của Cục Thuế TP Cần Thơ, người tham gia đoàn kiểm tra thuế của Thanh tra Bộ Tài chính, nói: “Cty kê khai thuế theo giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư của UBND TP Cần Thơ chứ không phải gian dối và Thanh tra Bộ Tài chính đã xử lý cho phép giảm 50% của thuế suất 28%, theo tôi là hợp tình hợp lý”.
Bà Trần Thị Huyền, Trưởng phòng Thanh tra Cục Thuế TP Cần Thơ, giải thích: “Chúng tôi căn cứ vào Thông tư 134 ngày 24-11-2007 của Bộ Tài chính, doanh nghiệp kê khai thiếu thuế thì phần phát hiện truy thu sẽ không được miễn giảm mà còn bị phạt. Thông tư không đề cập trường hợp cụ thể như Cty này và chúng tôi chưa hỏi Bộ Tài chính nhưng đã hỏi Tổng cục Thuế, được hướng dẫn chấp hành theo Thông tư 134”.
TGĐ Cty Thái Minh Thuyết bày tỏ vô cùng bức xúc. Ông nói: “Mong các ngành chức năng TP Cần Thơ và Trung ương xem xét có biện pháp xử lý phù hợp, tạo thuận lợi cho doanh nghiệp nói chung trong sản xuất kinh doanh. Riêng doanh nghiệp chúng tôi, đang chuẩn bị kiện ra tòa để nhờ pháp luật bảo vệ quyền lợi”.
