Như vậy, các trường THPT chuyên trên toàn quốc sẽ chỉ được tuyển học sinh các lớp chuyên. Các lớp không chuyên đã được tuyển sinh và tổ chức trong trường THPT chuyên tiếp tục được đào tạo nhằm đảm bảo sự ổn định cho học sinh.
Cũng theo quy định mới, lớp học trong trường chuyên sẽ vẫn được tổ chức theo môn học trong chương trình giáo dục phổ thông bao gồm: Ngữ văn, Lịch sử, Địa lí, Ngoại ngữ, Toán, Tin học, Vật lí, Hóa học, Sinh học. Mỗi lớp không quá 35 học sinh.
Kỳ thi tuyển học sinh THPT chuyên hằng năm thu hút đông đảo học sinh tham gia
Bộ GD&ĐT cũng quy định về việc chuyển trường của học sinh trường chuyên này sang trường chuyên khác. Nếu trường chuyên nơi học sinh chuyển đi và trường chuyên nơi học sinh chuyển đến đã tổ chức tuyển sinh bằng kỳ thi chung (chung đề thi, đợt thi) thì điều kiện được chuyển trường của học sinh trường chuyên là đạt đủ tiêu chuẩn trúng tuyển vào trường chuyên nơi chuyển đến.
Nếu trường chuyên nơi học sinh chuyển đi và trường chuyên nơi học sinh chuyển đến không tổ chức tuyển sinh bằng kỳ thi chung hoặc đã tổ chức tuyển sinh bằng kỳ thi chung nhưng học sinh không đủ tiêu chuẩn trúng tuyển vào trường chuyên nơi chuyển đến thì học sinh phải dự thi tuyển và đạt yêu cầu tuyển sinh bổ sung vào trường chuyên (nơi học sinh xin chuyển đến).
Hiện nay, mỗi tỉnh, thành phố đều có ít nhất 1 trường chuyên. Toàn quốc hiện có 78 trường chuyên, 71 trường thuộc quản lý của địa phương, 7 trường thuộc quản lý của cơ sở giáo dục ĐH. Trong số đó, gần một nửa số trường đang tuyển sinh lớp không chuyên.