Theo đó, Phó Thủ tướng giao Bộ Tài chính chỉ đạo Tổng cục Hải quan phối hợp chặt chẽ với Cơ quan điều tra - Bộ Công an, cung cấp hồ sơ, tài liệu để làm rõ các hành vi vi phạm pháp luật của các đối tượng liên quan đến vụ 213 container hàng hóa quá cảnh nhưng không xuất cảnh; tổ chức kiểm điểm, xử lý trách nhiệm của các tổ chức, cá nhân có liên quan theo đúng quy định của pháp luật.
Liên quan đến vụ việc, Cơ quan Cảnh sát điều tra (C46)- Bộ Công an đã bắt tạm giam ông Lê Vũ Nam (công chức Cục Hải quan TPHCM); ông Nguyễn Văn Lâm, SN 1973, công chức Đội Quản lý thuế, Chi cục Hải quan cửa khẩu cảng Sài Gòn khu vực 1; Trần Thanh Tùng, công chức Đội Thủ tục hàng hóa nhập khẩu - Chi cục Hải quan Chuyển phát nhanh, thuộc Cục Hải quan TPHCM.