Theo kế hoạch 2018, ngành kiểm toán sẽ tiến hành kiểm toán báo cáo quyết toán ngân sách nhà nước năm 2017 tại Bộ Tài chính và Bộ KH&ĐT. Đồng thời sẽ tiến hành kiểm toán 16 đơn vị về việc quản lý, sử dụng tài chính công, tài sản công năm 2017, như Bộ TN&MT, Bộ GTVT, Bộ Xây dựng, Tổng cục Hải quan…
Cũng trong năm tới, KTNN sẽ thực hiện Kiểm toán việc quản lý, sử dụng tài chính công, tài sản công năm 2017 tại Tổng cục Thuế và Chuyên đề công tác quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng (VAT) tại Tổng cục Thuế, Cục Thuế thành phố Hà Nội, Hải Phòng, Đà Nẵng, Hồ Chí Minh, tỉnh Quảng Ninh, Thanh Hóa, Nghệ An, Hà Tĩnh, Thừa Thiên Huế, Khánh Hòa, Bà Rịa - Vũng Tàu, Đồng Nai, Bình Dương, Vĩnh Phúc, Bắc Ninh,Cao Bằng, Lạng Sơn, Thái Nguyên, Tây Ninh
Về kiểm toán chuyên đề, năm 2018 sẽ triển khai với 23 chuyên đề, trong đó có công tác quản lý nợ công năm 2017 tại Bộ Kế hoạch và Đầu tư, Bộ Tài chính, Ngân hàng nhà nước và Ngân hàng Phát triển Việt Nam; việc quản lý và sử dụng nguồn vốn ODA giai đoạn 2015-2017 tại Bộ Kế hoạch và Đầu tư, Bộ Tài chính, Bộ Giao thông vận tải, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, Bộ Tài nguyên và Môi trường, Bộ Xây dựng, Bộ Y Tế, Bộ Giáo dục và Đào tạo; Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch; hệ thống công nghệ thông tin liên quan đến công tác quản lý thu ngân sách tại Tổng cục Thuế, Tổng cục Hải quan.
Bên cạnh đó, còn có kiểm toán chuyên đề về công tác quản lý nợ công năm 2017 tại Bộ Kế hoạch và Đầu tư, Bộ Tài chính, Ngân hàng nhà nước và Ngân hàng Phát triển Việt Nam.
Cũng nằm trong kế hoạch kiểm toán chuyên đề năm 2018 là đánh giá hiệu quả của các chính sách ưu đãi đầu tư tại các khu kinh tế: Đình Vũ - Cát Hải, Chu Lai, Phú Quốc, Nhơn Hội, Vân Đồn, Định An, Chân Mây - Lăng Cô, Vũng Áng, Đông Nam Nghệ An, Dung Quất, Nam Phú Yên, Nghi Sơn, Năm Căn và Vân Phong.
Chuyên đề kiểm toán đáng chú ý khác, là việc thực hiện Hợp đồng BT thanh toán bằng quyền sử dụng đất trên địa bàn thành phố Hà Nội giai đoạn 2013-2017: Dự án xây dựng nút giao thông trung tâm quận Long Biên; Dự án xây dựng tuyến đường liên tỉnh Hà Nội - Hưng Yên (đoạn trên địa bàn thành phố); Dự án đầu tư xây dựng tuyến đường từ đường Lê Đức Thọ đến Khu đô thị mới Xuân Phương (điểm cuối giao với đường 70).
