Ông Trương Duy Nhất từng bị phạt 2 năm tù về tội “Lợi dụng các quyền tự do, dân chủ xâm phạm lợi ích của Nhà nước, quyền, lợi ích hợp pháp của tổ chức, công dân”. Hiện tại, ông Nhất bị truy tố về tội “Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ” theo Khoản 3, Điều 356 BLHS với khung hình phạt tù từ 10 – 15 năm.
Theo điều tra, báo Đại Đoàn Kết từng đề nghị UBND TP Đà Nẵng cấp hoặc cho thuê 1 địa điểm thuận lợi trong thành phố làm trụ sở Văn phòng đại diện khu vực Trung Trung Bộ; giao Trương Duy Nhất liên hệ với chính quyền địa phương về việc này.
Năm 2003, bị cáo Nhất gửi văn bản, đề nghị UBND TP Đà Nẵng cho mua nhà công sản, không tính hệ số sinh lời để làm trụ sở văn phòng đại diện. Chính quyền Đà Nẵng sau đó đồng ý bán cho Văn phòng Trung Trung Bộ nhà đất tại số 82 Trần Quốc Toản với giá hơn 674 triệu đồng.
Song song, ông Nhất thỏa thuận với Phan Văn Anh Vũ (còn gọi Vũ “nhôm”) việc Vũ sẽ đứng ra nộp tiền mua nhà số 82 Trần Quốc Toản. Sau đó, Trương Duy Nhất sẽ làm thủ tục bán nhà đất này cho Cty Xây dựng 79 do Vũ làm giám đốc.
Ông Phan Văn Anh Vũ.
Năm 2011, Cty Xây dựng 79 đã gỡ bỏ biển hiện và đóng cửa văn phòng của báo Đại Đoàn Kết tại số 82 Trần Quốc Toản. Lúc này, khu đất đang đứng tên vợ của Phan Văn Anh Vũ. Báo Đại Đoàn Kết đã gửi văn bản, yêu cầu Cty Xây dựng 79: “Khôi phục ngay hiện trạng và trả lại nguyên trạng Văn phòng của Báo”. Đồng thời, Trương Duy Nhất cũng bị chấm dứt hợp đồng lao động phóng viên.
Theo Hội đồng định giá tài sản trong tố tụng hình sự Trung ương, khu đất số 82 Trần Quốc Toản có giá hơn 13,8 tỷ đồng. Từ đó, cơ quan truy tố cho rằng, hành vi của Trương Duy Nhất đã gây thiệt hại cho Nhà nước hơn 13,1 tỷ đồng (13,8 trừ hơn 674 triệu đồng).
Trong vụ án, cơ quan điều tra xác định một số lãnh đạo báo Đại Đoàn Kết có dấu hiệu “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng” nhưng với mức độ vi phạm nhỏ nên không cần xử lý hình sự.
Tòa án cũng sẽ triệu tập vợ chồng ông Phan Văn Anh Vũ tới tham gia phiên xử với tư cách người có quyền lợi nghĩa vụ liên quan. Ông Vũ hiện đang chịu án 30 năm tù trong 4 vụ khác nhau.