Anh Khánh chia sẻ, do đặc thù ở đơn vị sẵn sàng chiến đấu, suốt thời gian ở trong môi trường quân ngũ, anh và đồng đội không quản ngại vất vả, hiểm nguy tham gia nhiều hoạt động hỗ trợ nhân dân khắc phục hậu quả thiên tai, như lũ lụt, cháy ở các khu chung cư. Năm 2015, trong vụ cháy ở khu đô thị Xa La, anh cùng đồng đội chạy bộ từ tầng 1 lên tầng 36. Riêng anh cõng cụ già bị liệt 2 chân chạy thoát khỏi đám cháy theo cầu thang bộ từ tầng 36 xuống sân. Đó là một trong những kỷ niệm đáng nhớ nhất của anh.
Bên cạnh đó, trong vai trò là Bí thư Chi đoàn, anh Khánh có nhiều sáng kiến, kế hoạch đẩy mạnh việc học tập và làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh thông qua việc cụ thể hóa trong nhiều chương trình, hoạt động, như: Tháng Thanh niên, hè tình nguyện, huấn luyện, sẵn sàng chiến đấu… Trong công tác huấn luyện sẵn sàng chiến đấu, đoàn thanh niên Phòng Tham mưu Sư đoàn BB301 cụ thể hóa vào giờ học thanh niên, giờ ca trực thanh niên…
Đặc biệt triển khai mô hình Chi đoàn không có khối thuốc, nhằm kêu gọi, khuyến khích đoàn viên thanh niên trong đơn vị không hút thuốc lá và đạt hiệu quả tích cực.
Đại úy Nguyễn Duy Khánh là 1 trong 129 Bí thư chi đoàn tiêu biểu của các tỉnh, thành đoàn cụm Đồng bằng sông Hồng, các đơn vị Quân đội trên địa bàn có nhiều thành tích xuất sắc trong công tác Đoàn và phong trào thanh thiếu nhi tại địa phương sẽ tham gia Liên hoan Bí thư Chi đoàn tiêu biểu làm theo lời Bác năm 2019. Đây là những thủ lĩnh thanh niên làm theo lời Bác vừa “hồng” vừa “chuyên”, luôn vượt lên chính mình, không ngại khó khăn để làm tròn nhiệm vụ. Chương trình nằm trong khuôn khổ các hoạt động kỷ niệm 50 năm thực hiện Di chúc Chủ tịch Hồ Chí Minh (1969 – 2019), 20 năm Phong trào Thanh niên tình nguyện diễn ra vào hai ngày 20 và 21/8, tới.
Đây là một hoạt động ý nghĩa để đoàn viên thanh niên, đặc biệt là đội ngũ Bí thư chi đoàn tiêu biểu làm theo lời Bác hiểu rõ những giá trị lý luận và thực tiễn trong tư tưởng lời dạy của Chủ tịch Hồ Chí Minh trong Di chúc; ôn lại truyền thống vẻ vang 20 năm phong trào “Thanh niên tình nguyện”, tiếp tục đưa phong trào đi sâu vào cuộc sống của thanh niên, lan tỏa trong cộng đồng xã hội.