Mục tiêu tổng quát của quy hoạch mới theo hướng ổn định, bền vững, gắn phát triển nuôi với bảo vệ môi trường, cân đối cung cầu, điều chỉnh sản lượng và cơ cấu nuôi phù hợp với nhu cầu thị trường... Theo điều chỉnh bổ sung quy hoạch lần này, số lồng bè nuôi cá còn 2.591 bè, giảm 886 bè so với quy hoạch trước.
Khu vực nuôi cá ao hầm, cá chân ruộng, nuôi tôm trên cơ sở hệ thống kênh thủy lợi có đủ khả năng cấp nước cho vùng nuôi thủy sản, không làm ảnh hưởng đến cung cấp nước tưới tiêu cho nông nghiệp và nước sinh hoạt (ở hầu hết các địa phương cập sông Tiền, sông Hậu…, kênh cấp I, II, ở khắp 11 huyện thị thành trong tỉnh).
Sản lượng thủy sản nuôi đến 2010 theo điều chỉnh bổ sung 564.000 tấn, trong đó cá tra, cá ba sa 379.500 tấn (theo quy hoạch trước sản lượng nuôi 420.000 tấn, trong đó cá tra, cá ba sa 357.200 tấn).